最新一期的冷泉港实验手册（Cold Spring Harbor Protocols）已发布。本期的免费实验手册关注了两种模式生物，一是斑马鱼，谈到了RNA提取的优化、质量控制考虑和数据分析；二是线虫，通过RNA免疫共沉淀和RT-PCR分析RNA-蛋白复合物。
第一篇：
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Quantitative Real-Time RT-PCR (qRT-PCR) ofZebrafish Transcripts: Optimization of RNA Extraction, QualityControl Considerations, and DataAnalysis
作为模式生物，斑马鱼挺受欢迎。斑马鱼胚胎的快速发育为发育必需基因的研究提供了机会。了解基因在何时何地表达，以便于了解它们的功能，并实现基因敲除的控制。在基因表达研究中，实时定量PCR是最常用的方法。本实验手册就展示了从斑马鱼胚胎中抽提RNA的优化方法，质量评估，并强调了多个参考基因的使用。作者推荐将TRIzol抽提和柱纯化结合起来，这样产生的RNA质量要高于其中任一种方法。
这份实验手册是由新西兰奥克兰大学的研究人员提供的。作者改编了TRIzol（Invitrogen）和RNeasy MicroKit（QIAGEN）的操作步骤，并增加了一些额外步骤来改善RNA的产量和质量。另外，作者还推荐了一些qRT-PCR的分析软件。
第二篇：
Analysis ofRNA-Protein Complexes by RNA Coimmunoprecipitation and RT-PCRAnalysis from Caenorhabditis elegans
RNA免疫共沉淀是蛋白免疫共沉淀的延伸，它研究的是体内RNA-蛋白质复合物。此份实验手册来自德国马普研究院，它描述了如何在线虫中进行RNAco-IP。一般而言，用蛋白特异的抗体来纯化线虫中的目的蛋白及其相关的复合物成分。这其中可能包括了与其它蛋白组分相关联的RNA分子。为了鉴定特异的mRNA分子，先将所有的RNA分子与蛋白组分分离。随后将mRNA反转录成cDNA，再通过PCR扩增候选mRNA。众所周知RNA分子极易降解，在实验中避免RNase的污染相关关键。