1、 生物信息学服务
技术服务详细描述
一．基本服务
项目描述
电子克隆全长基因
根据已有的基因组序列信息，预测已知序列片断得全长基因信息，提供的信息还包括：
5' 端即转录起始位点区、第一个 ATG 、开读框架、终止密码子、 3' 端的确认。
差异基因的显著性分析
使用统计学方法进行差异基因筛选，得出具有显著性差异的基因。文件中的差异基因有登录到 Unigene 数据库的链接。
Gene Ontology 分 类 （形式 1 ）
差异基因的 Gene Ontology 分类（以每周最新更新的 Gene Ontology 数据库为准）。文件中的差异基因有登录到 Gene Ontology 数据库的链接。
Gene Ontology 分类 （形式 2 ）
差异基因的 Gene Ontology 分类（以每周最新更新的 Gene Ontology 数据库为准）
客户定义的基因分类（同形式 1 ）
按照客户的分类目标对差异基因进行筛选，并按照 Gene Ontology 进行分类。文件中的差异基因有登录到 Gene Ontology 数据库的链接。
Gene Ontology 的基因簇概率统计
最有效地判断差异基因中对于实验性状贡献最大基因功能分类及其包含的差异基因。基因功能分类以 Gene Ontology 为分类标准。文件中的差异基因有登录到 Gene Ontology 数据库和 NCBI 的 Gene 数据库的链接。
Pathway 分析
结合 kegg 数据库， biocarta 数据库，对基因进行 Pathway 分析。
分析差异基因在已有信号通路的分子调控网络中的作用关系
分析差异基因在客户订制的调控网络图中的作用关系
差异基因的共转录测（基于物理距离的预测）
根据差异基因的在染色体上的物理距离，判断共用转录起始为点的相关基因
Cluster 分析
针对客户提供的数据进行 cluster 分析
层次聚类分析
预测共转录的基因簇，预测并判断实验分组的相似性
基于层次聚类结果的共转录调控序列分析（局限于启动子上游区域）
对层次聚类预测的共转录基因分析可能的共有序列
时间序列或浓度梯度的基因表达谱分析
基于 K-mean 聚类的时间或浓度序列基因表达分析和基因功能类显著性分析
提供规模化的染色体定位分析
基因的染色体定位分析
基于 EST 的组织表达谱分析，以及进一步的基因共表达分析
根据 EST 的来源确定基因的组织表达谱信息，并根据 EST 表达差异和相同情况，来确定基因的表达谱，及表达的量化关系，进一步的判断基因在组织表达上是否存在联系。根据客户提供的基因，核查或者检索有关的基因的表达谱联系。
Oligo 设计
• 功能预测
依据提供的基因，设计出合适的 Oligo 探针。
基因的蛋白二级、高级结构功能域预测，基因功能预测
寡核苷酸合成
上海卓康生物科技有限公司
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