服务晶芯® miRNA微阵列服务
技术服务详细描述
服务描述
MicroRNA（miRNA）是细胞内存在的一组由基因组DNA编码、长度约22 个的核苷的非编码RNA。它们主要通过降解mRNA和抑制翻译两种方式调控生物体内的基因表达，在动植物的生长发育、细胞的分化和凋亡以及人类疾病的发生（如肿瘤）等过程中发挥着重要的调控作用。博奥推出的哺乳动物micro RNA芯片V2.0针对人576（包含Nature 杂志预测的有122个miRNA, Nature 2005, 434, 338-345.）、小鼠358个，大鼠238个成熟micro RNA。由于三者的miRNA保守性比较强，具有很多共同的序列，取三者的并集，一共设计了743条探针（数据来自2006年7月Sanger的数据库：miRBase 8.2）。博奥推出的植物micro RNA芯片V2.0针对Sanger数据库中2007年2月份植物全部的994条序列，去了冗余后，剩余了348个miRNA；然后加上了Zhu Jian-Kang在《Cell》上预测的4个，中科院遗传与发育所预测的74个，芯片上一共有426个miRNA对应的探针。该芯片技术服务通过先分离低分子量RNA进行荧光素标记，然后再进行芯片杂交和结果分析，可为客户提供准确的、高通量的miRNA分析服务。
哺乳动物miRNA芯片杂交图 人肿瘤组织、癌旁组织及正常对照的miRNA芯片数据类分析图
1 、三种阳性对照
★ 用于检测探针在芯片上固定的阳性对照：用Hex 标记的寡核苷酸点片作为片基、点样和探针固定的质控
★ 用于检测杂交的阳性对照（内源阳性对照）：用U6RNA和tRNA作为miRNA芯片的内源阳性对照
★ 芯片系统的阳性对照（外参对照）：用外源性序列互补的Oligo探针和重组miRNA掺入到实验的整个过程作为系统阳性对照
2 、阴性对照
★ 阴性对照设计了两种，一种是空白点样液体；另外一种是外源性无互补序列的探针，由于没有掺入对应的miRNA，其结果为阴性。阴性对照预期的杂交信号值很弱，它们的信号值不足以进入到后续的数据分析当中。
服务流程
★ 组织块和细胞RNA的提取
★ miRNA的分离
★ miRNA样品的荧光标记
★ 杂交与清洗
★ 芯片扫描
★ 数据分析
服务优势
★ 一次实验可检测已知的全部哺乳动物和植物的miRNA的表达情况，通量高
★ 通过聚类、SAM等数据分析，可以比较不同组织中miRNA表达的差异情况
★ 芯片miRNA的检测较传统的Northern Blot分析，敏感性和特异性较高
★ 拥有一套先进的芯片实验质控体系，对芯片制作及实验全过程实施严格的质控，保证实验结果的准确、可靠
上海卓康生物科技有限公司
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